Η διάτρηση του οισοφάγου είναι πραγματικό χειρουργικό επείγον. Έντονος πόνος στο στήθος μετά από εμετό ή ενδοσκόπηση χρειάζεται άμεση εκτίμηση.

Ο καρκίνος του οισοφάγου είναι σοβαρή νόσος. Η πρώιμη μορφή θεραπεύεται συχνά ενδοσκοπικά, ενώ η τοπικά προχωρημένη με συνδυασμένη θεραπεία.

Οι καλοήθεις όγκοι του οισοφάγου είναι σπάνιοι και συνήθως τυχαίο εύρημα. Πότε αρκεί η παρακολούθηση και πότε χρειάζεται αφαίρεση.

Το εκκόλπωμα του οισοφάγου είναι σάκος στο τοίχωμά του. Το εκκόλπωμα Zenker δίνει δυσκολία κατάποσης, αναγωγές και κακοσμία. Πότε χρειάζεται θεραπεία.

Ο οισοφάγος Barrett είναι αλλαγή του βλεννογόνου από χρόνια γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση. Δεν είναι καρκίνος. Πώς παρακολουθείται και πότε θεραπεύεται.

Στην αχαλασία ο οισοφάγος χάνει την ικανότητα να προωθεί την τροφή και η βαλβίδα στο κάτω άκρο του δεν χαλαρώνει. Διάγνωση με μανομετρία και θεραπεία.

Στην παραοισοφαγική κήλη τμήμα του στομάχου ανεβαίνει στον θώρακα δίπλα στον οισοφάγο. Πότε χρειάζεται επέμβαση και πότε αρκεί η παρακολούθηση.

Η παλινδρόμηση είναι η επιστροφή του περιεχομένου του στομάχου στον οισοφάγο. Πότε αρκούν τα φάρμακα, πότε χρειάζεται επέμβαση και πώς αποφασίζεται.